Analisis Protein Gen LCYB pada Mikroalga Laut Phaeodactylum tricornutum menggunakan Pendekatan Bioinformatika

LCYB merupakan gen yang memproduksi enzim Lycopene Beta Cyclase. Enzim Cyclase beperan dalam mengubah likopen menjadi ß-karoten. Gen terdapat pada diatom maupun mikroalga hijau. Berbeda dengan hijau, penelitian mengenai struktur protein selaku produk masih minim publikasi. Dalam ini dilakukan prediksi P. tricornutum secara bioinformatika. Untuk menganalisis perbedaan dan dibandingkan hijau M. zofingiensis. Konstruksi pohon filogenetik menggunakan perangkat lunak MEGA7. Analisis beberapa docking untuk memperkuat adanya interaksi antara hasil ligannya AutoDocksTools-1.5.6. zofingiensis memiliki hubungan kekerabatan jauh Tricornutum sehingga kemiripan juga berbeda. Mikroalga mengandung transmembran tidak dimiliki Tricornutum. Hasil menunjukkan yaitu likopen.